دری باز می شود و مهره ای طلایی ستاره ای را از بین می برد. آغاز قرن بیست و یکم است. بشریت نبرد برای سیاره زمین را به گودزیلا باخته است و برای یافتن یک خانه جدید به سمت ستاره ها برده می شود. اما جستجو ناقص می ماند و آنها و متحدان بیگانه شان مجبور می شوند به زامبان بازگردند. اما در غیاب او 20 هزار سال می گذرد و زمین به مکانی کاملاً متفاوت تبدیل شده است. گیاهان و حیوانات این سیاره به گودزیلا خدمت کرده اند. زمین سیاره هیولاها است و بزرگترین گودزیلای تاریخ با بیش از 300 متر ارتفاع بر آن حکومت می کند. گودزیلا از زمین قهرمان انسان، کاپیتان هاریو، می خواهد گودزیلا را شکست دهد و زمین را به انسان ها بازگرداند. او گونه عجیبی از انسان ها را می بیند، قبیله هوتوا. خواهران دوقلوی هوتوا، ماینا و میانا، او را نزد بازماندگان مک گودزیلا، یک سلاح باستانی ضد گودزیلا می برند که همه از زنده بودن آن در شکل نانوفلزی خود ترمیم شونده شگفت زده می شوند. از بقایای مکا گودزیلا، نانوفلزها یک شهر مکا گودزیلا را بازسازی کردند، سلاحی که می تواند گودزیلای زمین را نابود کند. با پیشرفت این استراتژی، تنش بین انسان ها و بیلوسالودو، یکی از قبیله هایی که هنگام ترک زمین به انسان ها پیوستند، افزایش می یابد. رهبر آنها، گالو-گو، معتقد است که راز شکست گودزیلا در استفاده از ابرقدرت های انسانی، یعنی همجوشی نانو فلزات نهفته است. اما هاریو مقاومت می کند، زیرا می ترسد وقتی هیولای خود را شکست دهند تبدیل به یک هیولای دیگر شوند. در نهایت، هاریو تصمیم می گیرد از ابزارهایی که در اختیار دارد برای شکست دادن گودزیلای زمین استفاده کند تا شهر مگاگودزیلا را شکست دهد و با کشتن گالو-گو از ترکیب نانومتال جلوگیری کند. اما دوست دوران کوکی او، یوکو، جذب ترکیبات نانو فلزی می شود و به کما می رود. بار دیگر، بشریت باخت. رهبر مذهبی نژاد Exif از زنده ماندن معجزه آسای هاریو شگفت زده می شود. شروع به جمع آوری فالوور کنید. exif با اکراه این را به عنوان هدف نهایی خود انتخاب می کند. میانا و ماینا در مورد موطفیس هشدار می دهند و هاریو نیز به قدم بعدی انسان ها شک دارد. بشریت زمینی بدون اینکه قصد شکست گودزیلا را داشته باشد، پادشاه گیدورا را می بیند که با لباس نور طلایی به زمین فرود می آید. زمین دوباره می لرزد، جنگ به ابعاد بالاتر می رود. گودزیلا دقیقا چیست؟ آیا بشریت شانسی دارد؟ آیا در چشم هری آینده ای وجود دارد؟ خودت ببین.