در سال 2050 پس از میلاد، تقریباً یک دهم خاک ژاپن در حال حاضر به دلیل تأثیر گرمایش جهانی زیر آب است. شهر توکیو نیز از این قاعده مستثنی نبود. اقتصاد ژاپن در اثر این فاجعه فلج شده است و دولت حاضر است برای احیای این کشور هر کاری انجام دهد. در نتیجه، دولت ژاپن "JESAS" را تشکیل می دهد، یک بنیاد نظامی که قصد شیطانی برای کنترل آینده ژاپن دارد. JESAS با ریختن زباله های هسته ای به فضا سر و کار دارد. JESAS برای اطمینان از محافظت خود در برابر سایر کشورها، "R.B." تسلیحات رباتیک که توسط خلبانان با "A.I. (شهود دقیق)" کنترل می شود. در طرف مقابل قانون، «مرز سبز» قرار دارد، یک آژانس حفاظتی متحد که توسط کشورهایی که عقاید مشابهی دارند، برای نجات زمین تشکیل شده است. این چهار مرد جوان با همراهی خلبانان JESAS، کانا و کازوتو، و دوتا کانگ و میرا یو از گرین فرانتیر، سرنوشت زمین را از طریق عشق، دوستی و اشتیاق به وظیفه خود رقم خواهند زد. (منبع: AniDB)