در جدول زمانی دیگر، ژاپن پس از شکست در جنگ جهانی دوم تقسیم شد. هوکایدو توسط اتحادیه ضمیمه شد، در حالی که هوشو و سایر جزایر جنوبی تحت حاکمیت ایالات متحده قرار گرفتند. یک برج غول پیکر مرموز در هوکایدو ساخته شد که به وضوح از هونشو قابل مشاهده است. در تابستان سال 1996، سه دانشآموز کلاس نهم قول دادند که روزی هواپیمایی بسازند که به آنها اجازه دهد راز برج را درک کنند، اما پس از اینکه ساواتری سایوری به کما رفت و برای درمان به توکیو منتقل شد، پروژه آنها ناتمام ماند. سه سال بعد، هیروکی فوجی ساوا متوجه می شود که سایوری هنوز در کما است و از تاکیکاوا شیراکا می خواهد که به او کمک کند راهی برای زنده نگه داشتن سایوری بیابد، اما چیزی که هنوز نمی دانند این است که بین بیهوشی سایوری و سایوری ارتباطی وجود دارد. اسرار برج و جهان هستی دارد